BluePippin系統(tǒng)包括一次性的5泳道預(yù)制膠電泳槽,運(yùn)行中,軟件通過(guò)實(shí)時(shí)光路檢測(cè),和參考泳道中的 DNA ladder進(jìn)行比對(duì),確定已經(jīng)設(shè)置回收長(zhǎng)度范圍的自動(dòng)化DNA段回收系統(tǒng)
DNA段到達(dá)洗提泳道(elution channel)的準(zhǔn)確時(shí)間。通過(guò)電極切換,打開洗提泳道,使目標(biāo)片段進(jìn)入洗提通道的回收室中,從而實(shí)現(xiàn)回收。然后電極再次切換,自動(dòng)化DNA段回收系統(tǒng)
洗提泳道關(guān)閉,剩余的DNA分子進(jìn)入原先的分離泳道(separation channel)。
系統(tǒng)參數(shù):
1.自動(dòng)化:軟件中設(shè)置回收片段起始bp和結(jié)束 bp,區(qū)間片段自動(dòng)回收到回收室中
2.回收精度:片段大小回收范圍cv值可控制在8%以內(nèi)
3.重復(fù)性:≥90%
4.回收通量:一次實(shí)驗(yàn)可以同時(shí)回收24個(gè)DNA樣品的大小片段
5.回收范圍(小片段):90-2000bp
6.回收范圍(長(zhǎng)片段):6-50kb
7.回收率:50-80%
8.回收速度:30-40分鐘回收500bp片段
9.防小片段污染:能非常高效去除引物二聚體、接頭二聚體等各種小分子片段,大大提高測(cè)序?qū)嶒?yàn)效率
10.大上樣量:1.5ugDNA
11.小上樣量:可對(duì)低至ng級(jí)的基因組DNA、ChIP-DNA(染色質(zhì)免疫共沉淀的基因組DNA)進(jìn)行回收
12.電壓:100V,或者脈沖場(chǎng)100V
13.光檢測(cè):470nm 激發(fā),525nm發(fā)射
14.測(cè)序平臺(tái):支持Illumine、Lifetech、Roche、Pacbio等主流二代、三代測(cè)序儀
15.應(yīng)用:三代測(cè)序Pacicbio High-pass文庫(kù)回收、二代測(cè)序常規(guī)的Paired-end文庫(kù)、RNA-seq文庫(kù)、miRNA-seq文庫(kù)、ChIP-seq文庫(kù)、外顯子組測(cè)序文庫(kù)、Nestera文庫(kù)、
PGM文庫(kù)、Proton文庫(kù)、RAD-seq文庫(kù)、甲基化測(cè)序文庫(kù)、目標(biāo)捕獲測(cè)序(Target-seq)轉(zhuǎn)基因測(cè)序文庫(kù)、臨床樣本測(cè)序文庫(kù)、病原微生物測(cè)序文庫(kù)等。