DGiNaSPTM系統(tǒng)工作流程：單細(xì)胞分離到NGS分析
流程特點(diǎn)：
· 更低成本：靶向基因檢測，避免看家基因占用的大量測序數(shù)據(jù)，大大節(jié)省了測序和分析成本；
· 罕見轉(zhuǎn)錄本更高檢出率：靶向定制panel，選定特定基因組合，提高UMI計(jì)數(shù)效率，罕見轉(zhuǎn)錄本檢測閾值更低；
· 超高細(xì)胞捕獲效率：大于60%，遠(yuǎn)高于市場上目前所有大通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)；
· 克服PCR擴(kuò)增偏差：引入單細(xì)胞測序金標(biāo)準(zhǔn)，分子標(biāo)簽，降低非特異性表達(dá)；
· 實(shí)現(xiàn)更高的分辨率：可以分辨更精細(xì)、微觀的細(xì)胞群和細(xì)胞亞種群；
· 反轉(zhuǎn)錄的磁珠超長穩(wěn)定存儲(chǔ)：完整cDNA可在磁珠微球結(jié)構(gòu)保存長達(dá)16周，隨用隨?。?/span>
· 靈活分樣組合：單次實(shí)驗(yàn)，通過的抗體標(biāo)記的方法，既可以提高樣品通量（*多可8個(gè)樣本同時(shí)建庫，可等分，可隨機(jī)組合）；又可以同時(shí)進(jìn)行單細(xì)胞蛋白和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合檢測，大大降低成本的同時(shí)，也為單細(xì)胞多組學(xué)研究提供了更高效的平臺(tái)
靶向設(shè)計(jì)
近年來高通量測序平臺(tái)的快速發(fā)展引發(fā)了測序成本迅速激進(jìn)的成本降低，但相對(duì)于大量的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析需求來說仍是十分昂貴的。我們通過特殊序列設(shè)計(jì)的方法，開發(fā)出了多款適用于不同客戶需求的靶向基因檢測試劑盒。具有以下優(yōu)點(diǎn)。
l 更低成本--提高單細(xì)胞測序效率，避免看家基因占用的大量測序數(shù)據(jù)，大大節(jié)省了測序和分析成本；
l 罕見轉(zhuǎn)錄本更高檢出率--選定特定基因組合，提高UMI計(jì)數(shù)效率，罕見轉(zhuǎn)錄本檢測閾值更低；
l 定制化—提供客戶定制化服務(wù)，專門的設(shè)計(jì)軟件和應(yīng)用專家提供專業(yè)的設(shè)計(jì)指導(dǎo)和服務(wù)
l 儲(chǔ)存--從樣本中得到的完整 cDNA 可在磁珠上穩(wěn)定存儲(chǔ)，允許將珍貴樣本保存長達(dá) 16 周。這可使用戶在時(shí)間允許的情況下靈活地對(duì)樣本進(jìn)行測序，并通過對(duì)儲(chǔ)存的磁珠池進(jìn)行等分或分樣來實(shí)現(xiàn)同一樣本的多個(gè)測定。
l 分樣--在磁珠上儲(chǔ)存的 cDNA可以分成一個(gè)或多個(gè)等分試樣，并使用定制或預(yù)先設(shè)計(jì)的組合（panel）進(jìn)行擴(kuò)增。通過提供對(duì)部分樣本進(jìn)行測序的選項(xiàng)和對(duì)樣本不同組合（panel）進(jìn)行測試的靈活性，進(jìn)一步降低成本。
分子標(biāo)記索引
當(dāng)對(duì)序列讀取進(jìn)行計(jì)數(shù)時(shí)，PCR 擴(kuò)增偏差可導(dǎo)致基因定量不準(zhǔn)確。DGiNaSPTM分子標(biāo)簽（UMI）技術(shù)為單個(gè)細(xì)胞的單個(gè)基因分配了的分子索引，也稱為“分子條形碼”。實(shí)驗(yàn)者可借此克服擴(kuò)增偏差，更準(zhǔn)確地計(jì)算轉(zhuǎn)錄水平。
磁珠上分子標(biāo)簽結(jié)構(gòu)。Univ：通用Illumina接頭序列。CL：Cell specific sequence細(xì)胞特異序列。大約有88.5萬種細(xì)胞標(biāo)記。UMI：Unique molecular index。每個(gè)mRNA分子有相同標(biāo)簽。UMIs種類：約6.6萬。Poly-dT：mRNA尾連接。
單分子標(biāo)記流程示意圖
我們?yōu)榭蛻籼峁┒喾N數(shù)據(jù)分析安裝分析軟件和可視化工具，可構(gòu)建自動(dòng)化的數(shù)據(jù)分析通道。只需對(duì)簡單的生物信息學(xué)基本了解即可方便的進(jìn)行初級(jí)分析和二級(jí)分析以及數(shù)據(jù)可視化等各種數(shù)據(jù)分析和挖掘，直接生成可用于發(fā)表的結(jié)果和圖片
工作條件：
電壓要求：100-240 Vac, 50-60 Hz, 25 W；
溫度要求：16-28°C；
濕度要求：室溫，不高于85%；
具體參數(shù)
芯片適用樣品類型:一種微流體芯片兼容不同大小及不同類型的真核細(xì)胞（貼壁細(xì)胞、懸浮細(xì)胞、組織、血液等）；
樣本處理通量：反應(yīng)孔數(shù)量達(dá)到了22萬個(gè)，1-8個(gè)通道，單個(gè)通道每次可捕獲100-10000單細(xì)胞；
自動(dòng)化：一體化主機(jī)設(shè)置，可從細(xì)胞分離到建庫完成需要12.5小時(shí)，所有步驟均在一個(gè)單元完成實(shí)現(xiàn)全自動(dòng)分離建庫，實(shí)現(xiàn)快速裂解細(xì)胞對(duì)基因表達(dá)影響*小，**地獲得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)；
分區(qū)與標(biāo)簽數(shù)：每次運(yùn)行產(chǎn)生≥9萬個(gè)納升級(jí)分區(qū)，含有不少于270 萬個(gè)的序列標(biāo)簽、**標(biāo)簽或ATAC標(biāo)簽（每個(gè)標(biāo)簽由16個(gè)堿基構(gòu)成）；
細(xì)胞捕獲效率：在樣本細(xì)胞群體中捕獲≥60%的單細(xì)胞，每 1000 個(gè)細(xì)胞中含有 雙細(xì)胞的比例低于0.9%；
文庫測序儀兼容性：系統(tǒng)提供 Illumina和華大基因兼容測序文庫，建庫樣本滿足 Illumina 和華大基因測序儀要求；
細(xì)胞直徑大?。?/b>≤40um；大于40um抽提細(xì)胞核檢測試劑盒；
多樣本標(biāo)記: 配套原廠試劑，可以完成細(xì)胞樣本及細(xì)胞核樣本混樣建庫，細(xì)胞樣本混樣單個(gè)通道達(dá)到10種樣本標(biāo)簽，細(xì)胞樣本或細(xì)胞核樣本混樣單次實(shí)驗(yàn)可達(dá)到80個(gè)樣本建庫實(shí)驗(yàn)；
條碼掃描器: 配備2D 條形碼掃描器，掃描試劑信息并跟蹤試劑使用情況；
軟件包括：分析軟件和可視化軟件，免費(fèi)安裝，免費(fèi)升級(jí)，自帶誤操作提示及更正功能，支持 Wifi，以太網(wǎng)，USB 接口輸出，兼容 LIMS 系統(tǒng)；
目前已有多款經(jīng)驗(yàn)證的試劑盒可選：
□ 單細(xì)胞的基因 3’表達(dá)譜測序文庫試劑盒
□ 單細(xì)胞的基因5’表達(dá)譜測序文庫試劑盒
□Onco-BC 靶向檢測試劑盒（panel）--與乳腺癌和**細(xì)胞相關(guān)的 400 個(gè)基因檢測
□ **反應(yīng)檢測試劑盒（panel）--**細(xì)胞類型譜分析
□ T-細(xì)胞靶向檢測試劑盒（panel）--T細(xì)胞類型譜分析
□ 單細(xì)胞核的ATAC-Seq測序文庫試劑盒
□ 多聚甲醛固定后單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序文庫試劑盒
□ 客戶自定義檢測試劑盒（panel）--用戶可選擇100-500個(gè)靶基因進(jìn)行檢測，專業(yè)的應(yīng)用工程師將為您的設(shè)計(jì)提供技術(shù)支持
